Entrevista Dr.I Lipkin: Solicitud fondos estudio microbioma
Publicado: 19 Feb 2014, 11:05
A mí no, Eli. Las gracias al ratón transgénico que he conseguido diseñar en mi laboratorio clandestino. Él es el que traduce.Eli escribió:Añado mi granito de arena en azul Gracias holapollo por tu trabajazo!
Bueno, seamos serios.
holapollo escribió:
A fin de resaltar la importancia de esta entrevista, he creado este hilo para colgar en él su traducción.
El enlace a la entrevista original en inglés fue colgado por Sushi y por EndSFC con pocos días de intervalo, en sendos hilos.
viewtopic.php?t=2968
viewtopic.php?p=18805
Entre {} (llaves) he incluído alguna frase que, aunque en el original se entiende implícita, he creído que añadirla en la traducción podría ayudar a la comprensión.
Entre (()) (dobles paréntesis) son anotaciones mías. Y en color, algunos términos clave.
Enlace al artículo original :
Entrevista: El llamamiento de Ian Lipkin para conseguir el Millón de Dólares del estudio sobre microbioma
10 DE Febrero 2014Simon McGrath consiguió recientemente una entrevista con el mundialmente famoso Dr Ian Lipkin, un científico que sigue creyendo que el SFC-ME tiene una causa física, ((increíble que aún haya que añadir este comentario)) a fin de dar más detalles sobre sus planes para un importante estudio sobre el microbioma intestinal, y para averiguar por qué pide el el apoyo de los pacientes...
El Dr W. Ian Lipkin ha demostrado un claro compromiso con la investigación en SFC-EM. Primero por su estudio en busca de Bornavirus en la década de los 90, después vino el estudio histórico que descartó al XMRV como causa, y más recientemente hemos tenido noticias acerca del amplio estudio inmuno/patogénico, con la extensa colaboración de muchos médicos e investigadores punta, incluyendo al Dr. Dan Peterson y al profesor José Montoya.
En estas investigaciones ya había encontrado claras señales de activación inmune en los pacientes y, cuando hablé con él, Lipkin estaba claramente emocionado por los resultados finales que surjan del estudio:
Lipkin cree que la activación inmune puede ser la responsable de gobiernar los síntomas asociados con el SFC. Y que la activación inmune estaría provocada por microbios, pero no en la sangre, sino que se la causa se encontraría en el extenso ecosistema de bacterias, virus y hongos, que constituyen el microbioma intestinal. ((Lo que normalmente llamamos flora intestinal))Me gustaría poder revelar más, pero sólo se ha presentado un documento y los detalles están reservados hasta su publicación.
Sin embargo, él carece de fondos para seguir con esta investigación y por esto apela a la comunidad de pacientes para obtener el millón de dólares que necesita para hacer el trabajo. ¿La recompensa? Una mejor comprensión de la enfermedad y la posibilidad de nuevos tratamientos.
La pistola humeante
La activación inmune que ha encontrado podría explicar la fatiga: es un síntoma casi general de infecciones, como la gripe, y es, en realidad la consecuencia de la activación inmune y no está causada por los propios patógenos.
(EndSFC, ¿me podrías aclarar si, como creo, esto es así en todos los casos, es decir, no sólo en EM-SFC sino en todos los casos en que existe una lucha contra un patógeno? Es decir, la fatiga en gripe, hepatitis, brucelosis... es a causa de los propios mecanismos de lucha contra la infección y no de la acción de los patógenos)
Lo mismo podría decirse de otros síntomas de SFC-EM, incluyendo los trastornos del sueño y la disfunción cerebral ((síntomas neurocognitivos)) que son, a su vez, síntomas típicos de la activación inmune.
Lipkin está dispuesto a edificar sobre este base. Él cree que la activación inmune es como el humo de un arma recién disparada, y ahora quiere localizar quién apretó el gatillo.
"Dr W. Ian Lipkin" escribió: Me entusiasma más que nunca... a ver si podemos identificar el desencadenante
Hay varios lugares verosímiles donde buscar a los culpables que desencadenan la activación. Uno de ellos sería en los leucocitos en la sangre: algunos virus podrían estar escondidos en las células y por ello no han sido encontrados por la búsqueda inicial en plasma sanguíneo (Lipkin ya cuenta con un estudio de glóbulos blancos a punto para iniciarlo)
Sin embargo, su atención se centra especialmente en el microbioma, el gran ecosistema de microbios que viven en nuestra piel y en la "cámara de aire" que desciende desde nuestra boca.
Hay por lo menos un billón de microbios en el microbioma intestinal, y hay más células inmunitarias en el intestino que en cualquier otro sitio: es un buen lugar para la caza de los microbios que podrían estar provocando la activación inmune.
Cada vez más, se acepta la vinculación existente entre las enfermedades graves y las alteraciones del microbioma. El ejemplo más llamativo es la súperbacteria* Clostridium difficile (C. diff), que se ha convertido en un problema importante en los hospitales.
* ((Una súperbacteria es aquélla que ha alcanzado resistencia a varios antibióticos, convirtiéndose así en un grave problema cuando causa una infección))
C. diff vive normalmente en nuestros intestinos, en población reducida, sin causar daños, pero puede asumir el control (sobre todo si las bacterias "buenas" son aniquiladas) causando diarrea e incluso la muerte. Afortunadamente, los médicos han descubierto que los casos graves de infección por C. diff pueden tratarse con relativa facilidad mediante la restauración del microbioma. Desgraciadamente, la solución comporta un trasplante fecal.
El potencial para el tratamiento de la enfermedad mediante la restauración del microbioma es una de las razones por las que este área de investigación está atrayendo tanta atención. Este artículo reciente (es un enlace a http://phoenixrising.me/archives/20926 también muy interesante) explica más sobre el microbioma, sobre cómo se podría vincular a SFC-EM y contempla otra investigación que se está realizando.
Si la respuesta fuera sencilla, ya estaría solucionado, a estas alturas.
El Síndrome de Colón Irritable es otro ejemplo. Aquí se postula que la inflamación que resulta de cambios en el microbioma. (enlace: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23431991). El equipo de Lipkin ha estudiado a las mujeres en el África subsahariana y encontró que la presencia de ciertas bacterias en el microbioma vaginal aumenta el riesgo de infección por VIH. Lipkin piensa que el microbioma intestinal podría estar jugando un papel igualmente importante en SFC-EM:
En otras palabras:Por analogía con situaciones animales y humanas, vemos que las diferentes poblaciones de hongos, bacterias y virus en el colon pueden tener un impacto en el sistema inmunológico y dan lugar a la activación de citoquinas, que podrían causar los cortejos de síntomas que vemos en SFC-EM
cambios en microbioma> activación inmune> síntomas de EM / SFC
Pregunté a Lipkin si esto señala que la inflamación sería causada por la acción de microorganismos concretos, y me dijo que ciertamente, es posible. Sin embargo, agregó, otra posibilidad sería que un crecimiento excesivo de "bacterias malas"
podría formar una película, impidiendo a las bacterias "buenas'' interactuar positivamente con el sistema inmunológico (ver este artículo: http://phoenixrising.me/archives/20926) Una vía indirecta de provocar disfunción inmune.
El papel exacto que los microorganismos intestinales juegan en la salud y en el desarrollo de la enfermedad es complejo y aún está por determinar. Hay muchas hipótesis plausibles, dice Lipkin, y sólo la investigación puede demostrar cuáles (si las hay) son correctas.
Si el microbioma es la causa, ¿es tratable?
Si el microbioma es la causa, o una de las causas, o incluso tan sólo un factor que contribuye al SFC-EM, puede ser relativamente fácil de tratar, tal vez con probióticos, las dietas de exclusión, fármacos, o incluso trasplantes fecales.
¿Causa o efecto?
Por supuesto, el primer paso en este proceso sería demostrar que existe algún vínculo XXXXXX fuerte entre el microbioma y SFC-EM . Si se encuentra uno, entonces el siguiente paso sería buscar la evidencia que desempeña un papel causal: es decir, ¿qué cambios en el microbioma causan disfunción inmune, en lugar de ser ellos mismos una consecuencia de, o simplemente, un rasgo asociado a la disfunción inmune?
Lipkin dice que una opción sería utilizar un modelo animal: la idea sería introducir los microbios sospechosos de desencadenar la SFC-EM en el microbioma intestinal de los animales, para ver si esto conduce a síntomas similares y a la activación inmune, como se ve en el ser humano. Algo que se ha utilizado para estudiar el síndrome metabólico .
La medicina personalizada
Si hay evidencia de un papel causal, Lipkin dice que buscaría establecer ensayos clínicos de tratamientos que podrían incluir probióticos, antibióticos seguido de prebióticos, las dietas de exclusión y, posiblemente, incluso los trasplantes fecales. Él cree que el microbioma no sería la única causa de la enfermedad, pero los cada clase de organismo, es decir, hongos, bacterias y virus, causarían, respectivamente, tres tipos separados de disfunción inmune.
Lipkin llama 'endofenotipos' estos diferentes tipos y podría dar lugar a la medicina personalizada, en la que el tratamiento particular dependería de la forma específica de la enfermedad. Habrá endofenotipos adicionales en el intestino, como los endofenotipos genéticos, y es muy poco probable que el microbioma explique todas las formas de SFC -EM, pero este enfoque permitiría abordar una parte sustancial de los casos.
El presupuesto desglosado del estudio
El estudio propuesto por Lipkin buscará en tres líneas vitales: bacterias, hongos y virus en el microbioma de 100 pacientes y 100 controles reclutados para un estudio previo del NIH. Costará un millón de dólares de dólares:
1. Recogida de muestras: $ 150,000
Recolección de muestras de heces (y sangre) de pacientes, incluyendo el control de si el diagnóstico inicial de SFC-EM sigue siendo válido, y el envío de muestras refrigeradas a los laboratorios de Columbia.
2. Secuenciación del microbioma fecal y análisis: $ 317.000
- purificar y realizar secuenciación de alto rendimiento de virus, hongos y bacterias, por separado
- La secuenciación completa de los virus; secuenciación parcial para identificar bacterias (utilizando 16S rRNA ) y hongos (con ITS, el "código de barras de hongos ')
- Generar un perfil del microbioma para cada paciente, independientemente para las bacterias, hongos y virus.
Comparación entre el microbioma de los pacientes y los controles sanos: bacterias, hongos y virus que difieran en prevalencia entre los sujetos con SFC y los controles se considerarán candidatos para contribuir a la enfermedad o a la salud.
3. Desarrollo de ensayos de gran precisión en tiempo real por PCR para confirmar los hallazgos y los niveles de microbios: $ 328,000
Esto cuantificará cada microbio de interés (la secuenciación de alto rendimiento da una indicación de la cantidad, pero es menos precisa que la PCR en tiempo real ).
Posiblemente, lo más importante no es la presencia o ausencia de un microbio, sino la cantidad del mismo, al igual que con C. difficile. Estos ensayos también se utilizarán para comprobar que los microbios clave no se han perdido en cualquier paciente o los controles que fueron negativos para ellos en la secuencia inicial, porque los ensayos de PCR son más sensibles que la secuenciación de alto rendimiento.
4. Análisis de citoquinas: $ 86.000
El estudio, además, cuantificará citoquinas en sangre y llevará a cabo el análisis de datos para ver si existe una relación entre perfiles de citoquinas y perfiles inmunes. Esto proporcionaría una importante evidencia sobre la relación entre el microbioma y la disfunción inmune, (la hipótesis guía de este estudio). Se requerirá el análisis sofisticado de la gran cantidad de datos generados por el microbioma y los perfiles de citoquinas; afortunadamente, el Centro Lipkin de Infección e Inmunidad tiene un equipo de bioestadísticos dedicados a este tipo de trabajo.
5. Desarrollo de las pruebas de anticuerpos a microbios importantes identificados por el trabajo: $ 249.000
Podrían encontrarse especies individuales o grupos específicos de microbios ((entiendo que se refiere a microbios hallados en muy pocos sujetos)), pero las pruebas de anticuerpos desarrolladas por el laboratorio de Lipkin, deberían ser útiles para comprobar con mayor facilidad si los mismos problemas encontrados en la muestra, se encuentran en una población de pacientes más amplia.
Además de servir como una guía hacia los tratamientos, los ensayos de PCR y las pruebas de anticuerpos pueden servir como una prueba de diagnóstico para SFC-EM.
Un científico con urgencia en la búsqueda de respuestas
Dr. Lipkin es un científico con prisa en encontrar respuestas. Eso es así tanto en su trabajo para tratar de detener una nueva pandemia en sus inicios, como en su trabajo en SFC-EM.
Quiere rastrear todas los pistas posibles, tan pronto como sea posible, en lugar de esperar los resultados de un solo estudio para planear uno nuevo en el caso de que el primero se demostrase errado.
Por eso ha diseñado un amplio estudio en busca de patógenos específicos, tales como EBV, utilizando la secuenciación de forma intensiva junto con la búsqueda de cualquier otro patógeno, conocido o desconocido.
Buscará los patógenos en el plasma sanguíneo, pero también tratará de buscarlos en leucocitos.
Ha diseñado el estudio tanto para marcadores inmunes, incluyendo citoquinas, como para los agentes patógenos. Y los resultados significativos de la activación inmune señalarán la utilidad de apostar a más de un caballo.
Además de todo esto, Lipkin ha invertido en un estudio de expresión de genes, utilizando para él muestras del estudio principal, cuyos resultados podrían arrojar, se espera que en breve, nuevas pistas en epigenética y en genómica.
El Dr. Lipkin ha comprometido una gran cantidad de tiempo del equipo de 60 personas en su institución para llevar a cabo numerosos estudios, todos con el objetivo de descubrir qué es lo que realmente está pasando en el SFC/EM
¿Demasiadas búsquedas, demasiado rápido?
Sin embargo, parece que el NIH no tiene tanta prisa, ya que se ha negado a financiar el estudio en este momento.
Hasta ahora el NIH sólo ha comprometido cantidades relativamente pequeñas de fondos para SFC-EM, alrededor de 5 millones de dólares al año, comparado con cerca de 115 millones anuales para Esclerosis Múltiple, y 284 millones para el asma.
Su registro de financiación señala que las prioridades del NIH van en otra dirección.
Así que, como dice Lipkin, "estamos estancados". Es posible tanto que el NIH financie este trabajo en el futuro, como que no lo haga en absoluto.
La pregunta es, ¿queremos esperar?
El Dr. Lipkin ha hecho un llamamiento a los pacientes para financiar su último estudio que pretende "cazar" en el microbioma intestinal al desencadenante de la activación inmune, activación que encontró en su estudio sobre SFC-EM. Y necesita un millón de dólares contante y sonante para financiar el estudio descrito anteriormente."Ya estamos muy atrasados respecto a donde deberíamos estar"
En realidad, el presupuesto alcanza a algo más de un millón de dólares: 1'13 millones de dólares, de los cuales, 140.000 dólares serían los costes de mantenimiento de los equipos de alta tecnología utilizada, y los costes generales de laboratorio sumarían1.270.000 dólares en total. Sin embargo, el objetivo inicial se ha fijado en 1 millón de dólares.
En su transmisión por televisión de los CDC a los pacientes en septiembre pasado, Lipkin explicó que el Proyecto Microbioma se encontraba detenido por la falta de fondos, y exhortó a los pacientes a contactar a sus representantes en el Congreso.
También solicitó directamente a los pacientes que podían pagar para hacerlo, invertir en investigación:
¿Cuánto tiempo se necesita para conocer los resultados? "Dentro de un año", dijo LipkinPuede que no sea muy digno pasar el sombrero, pero eso es exactamente lo que estoy haciendo
El hombre está en un apuro, y el estudio está totalmente configurado y listo para empezar en cuanto se disponga de fondos.
Cuando le dije a la Dra. Mady Hornig, la investigadora principal en este estudio, que estaba entrevistando al Dr. Lipkin, ella añadió: "Estupendo, necesitamos los recursos para hacer esto"Mientras pueda hacerlo, lo haré. Estoy ansioso por empezar, soy optimista en cuanto a resultados, no es sólo un ejercicio académico, podría conducir a un tratamiento
Crowdsourcing: Juntos podemos hacerlo realidad
((Imagino que aquí hay un error. Me parecería más adecuado el término crowdfunding)):
http://es.wikipedia.org/wiki/Micromecenazgo
Yo creo que somos muy afortunados por tener al Dr. Lipkin en nuestro caso, y pienso que deberíamos apoyar su nuevo estudio, que se llevará a cabo en su Centro de Infección e Inmunidad de la Universidad de Columbia, el mayor y más avanzado centro académico del mundo en el descubrimiento e identificación de microbios y en diagnóstico.
Vanessa Li, miembro de Phoenix Rising y recaudadora de fondos:
¿Por qué no apoyar esto mediante crowdsourcing/crowfounding? Todos estamos perdiendo un tiempo valioso en nuestras vidas
Vanessa Li, paciente de SFC-EM, respondió a la convocatoria de Lipkin el pasado año, poniéndose en contacto con su oficina y sugiriendo crowdsourcing de una manera similar a MeandYou, iniciativa que gracias a los esfuerzos de la doctora María Gjerpe había conseguido la sorprendente cantidad de medio millón de dólares para el ensayo de Rituximab en Noruega en sólo 90 días.
Lipkin era médico en San Francisco al inicio de la epidemia del SIDA.
(( He encontrado sólo esta referencia: Lipkin WI, Parry G, Kiprov D, Abrams D. Inflammatory neuropathy in homosexual men with lymphadenopathy. Neurology. 1985 Oct;35(10):1479–1483. [PubMed]))
y comentó cómo, cuando el gobierno se resistía a pagar, la mayor parte del importante trabajo inicial fue financiado por donantes privados, por lo que está muy abierto a esta posibilidad.
Él continúa solicitando fondos para su trabajo de las instituciones, pero como eso no ha funcionado solicita a los pacientes si pueden hacer posible el estudio , y ha concedido esta entrevista para lanzar la apelación del millón de dólares.
Donar al estudio del microbioma en SFC-EM
Acabo de donar y espero que muchos otros pacientes lo harán también. Simplemente haga clic en el botón de abajo y siga las instrucciones. La opción es donar a la investigación en SFC, pero en la siguiente página se pueden añadir "instrucciones especiales" tales como "para el estudio del microbioma".
https://giving.columbia.edu/giveonline/ ... lloc=21677
Sólo necesitamos 1 dólar por cada paciente Estadounidense para alcanzar la meta . O que uno de cada diez pacientes done 10 dólares.
Si la gente quiere hacer más para ayudar (y esto es un gran objetivo) pueden ayudar a promover esta iniciativa de crowdsourcing en este nuevo grupo
http://forums.phoenixrising.me/index.ph ... oup-detail" onclick="window.open(this.href);return false;
o enviar un correo a Vanessa Li:
[mail="Vanessa Li"][email protected][/mail]
Por último, quiero añadir lo siguiente:
El CDC dice que hay actualmente más de un millón de pacientes con SFC-EM, sólamente en EE.UU. No hay ninguna razón por la cual, si todos los pacientes conocieran la apelación del Dr. Lipkin y donasen 1 dólar, se dejase de recaudar el millón de dólares. Un reputado investigador, haciendo trabajo de gran calibre está tomando un serio interés en la búsqueda de la causa de nuestra desesperantemente infrainvestigada enfermedad. ¡Es el momento de actuar!
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Hasta aquí la entrevista. Reitero el agradecimiento a Eli por su ayuda en la traducción, y aconsejo, tanto leer los comentarios en el enlace de EndSFC:viewtopic.php?p=18805
como en la propia entrevista original:
http://phoenixrising.me/archives/21929?preview_id=21929